Das Innere der Kirche ist sehr schlicht gehalten. Von der ehemaligen Ausstattung sind nur noch Teile erhalten. In den Boden eingebrachte gotische Majuskeln - das "AVE MARIA..."sind schlicht und in Deutschland einmalig erhalten. Unter der Orgelempore wurde 2017 ein Wandbild von 1722 freigelegt - König David mit Harfe.
Die Klosterkirche St. Marien wurde als "Kulturerbe von nationaler Bedeutung" seit 2012 im Innenbereich restauriert. Es ist die erste Innensanierung seit 1897. Die umfassenden Restaurierungsarbeiten sind abgeschlossen und die Kirche erstrahlt seit 2017 in altem und neuen Ganz. Die Kirche ist in der Regel zwischen Ostern und Reformationstag täglich von 11.00 - 15.00 Uhr geöffnet.
Führungen durch die Klosterkirche können bei Frau Rosenzweig im Gemeindebüro angemeldet werden. Dauer der Führungen: ca. 35 min. Es wird kein Eintritt und keine Führungsgebühr erhoben, um eine kleine Spende wird am Ausgang gebeten.